Historia powstania specjalistycznej placówki dla dzieci z autyzmem sięga 1992 r roku. Grupa rodziców zrzeszonych w Oddziale Krakowskiego Krajowego Towarzystwa Autyzmu zainicjowała powstanie Ośrodka Terapeutyczno-Szkolnego dla Dzieci Autystycznych. Pomysłodawczynią była Alina Perzanowska, a decyzję o powołaniu Ośrodka podjął Wojewoda Krakowski Tadeusz Piekarz wspólnie z kuratorem Jerzym Lackowskim. oryginalnym pomysłem inisjatorów Osrodka było stworzenie instytucji zapewniającej opiekę medyczną i edukację specjalną w jednym miejscu. Stąd, od chwili powstania personel Osrodka stanowi zespół pracowników służby zdrowia i edukacji. Tak jest do dzisiaj, mimo wielu zmian organizacyjnych jakie nastapiły od 1992 roku.

W ciągu tych lat "zdrowie" i "edukacja" przestały podlegać władzom wojewódzkim (czyli państwowym) i stały się samorządnym zadaniem Gminy Kraków, powołano Kasy Chorych, potem Narodowy Fundusz Zdrowia, otwarta służba zdrowia musiała się usamodzielnić a filia szkoły specjalnej w naszej placówce przekształciła się w samodzielną szkołe. Liczba dzieci w ciągu 13 lat powiększyła się prawie sześciokrotnie (aktualnie 53 dzieci), a obecny budynek jest trzecią z kolei naszą siedzibą.

Pomimo tych wszystkich zmian założenie pozostaje to samo - sprawowanie zintegrowanej opieki, edukacji i rehabilitacji dla dzieci z autyzmem i innymi zaburzeniami rozwoju, które są sprzężone z autyzmem.

Obecna struktura placówki, której dwie składowe części są o wiele bardziej samodzielne niż na początku (ze względu na sposób finansowania), wygląda następująco:

Zespół Szkół nr 13
Szkoła Podstawowa
Gimnazjum

NZOZ Ośrodek dla Osób z Autyzmem
Oddział dzienny dla dzieci uczących się w szkole
Poradnia dla dzieci z Autyzmem i innymi Zaburzeniami rozwoju
Gabinet Profilaktyki i Pomocy Przedmedycznej